diplomsko delo
Tilen Pajk (Avtor), Jernej Jakše (Mentor)

Povzetek

Nanopore sekvenciranje je perspektivna nova tehnologija z začetki uporabe v prejšnjem tisočletju. Deluje na podlagi zaznavanja sprememb v toku, ki teče skozi poro v membrani. Spremembe toka povzroča prehajanje molekule skozi nanoporo, ki je vezana v membrano. Oxford Nanopore Technologies je podjetje, ki je odgovorno za mnogo napredkov na tem področju in je leta 2014 izdalo napravo MinION, ki ponuja mnoge prednosti pred ostalimi metodami sekvenciranja nove generacije. Čeprav so imele začetne različice težave z doseganjem visoke natančnosti, so izboljšave naprave to dvignile do standardov, ki so postavljene pri ostalih tehnologijah nove generacije. Zahteve moderne diagnostike se pomikajo stran od tradicionalnih metod proti hitrejšim tehnologijam, ki lahko rezultate podajo v krajšem ali celo realnem času. Nanopore tehnologija se je dokazala kot nepogrešljiva pri spremljanju in ukrepanju v mnogih izbruhih ebole in drugih tropskih bolezni, kjer so fizične lastnosti in zmogljivosti MinION-a ekipam omogočile sekvenciranje na prej nedostopnih lokacijah in s tem izboljšale nadzor situacije ter omogočile natančnejši vpogled v spreminjanje patogenov skozi potek izbruhov. Hitrost sekvenciranja, zmogljivost podajanja rezultatov v realnem času, lahka uporaba in prenosljivost, so razlogi, da se MinION naprava vedno več uporablja v diagnostične namene za živali, rastline in druge vrste povsod po svetu.

Ključne besede

nanopore;MinION;diagnostika;sekvenciranje;bioinformatika;

Podatki

Jezik: Slovenski jezik
Leto izida:
Tipologija: 2.11 - Diplomsko delo
Organizacija: UL BF - Biotehniška fakulteta
Založnik: [T. Pajk]
UDK: 601.4:577.21:575.112(043.2)
COBISS: 75418115 Povezava se bo odprla v novem oknu
Št. ogledov: 286
Št. prenosov: 40
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Angleški jezik
Sekundarni naslov: Bioinformatic analysis in diagnostics using nanopore technology
Sekundarni povzetek: Nanopore sequencing is a promising new technology with beginnings in the previous millennium. It works by detecting changes in the electrical current flowing through a nanopore embedded in the membrane. The changes are caused by the passage of a charged molecule through a nanopore bound to the membrane. Oxford Nanopore Technologies is the company responsible for many advances in this field. In 2014, they released the MinION device, which offers many advantages over other next-generation sequencing methods. Although the first versions struggled to achieve high accuracy, improvements have raised the device to the standard of other next-generation technologies. The demands of modern diagnostics are moving away from traditional methods to faster technologies that can deliver results faster or even in real time. Nanopore technology has proven essential in monitoring and responding to many outbreaks of Ebola and other tropical diseases. The physical properties and capabilities of the MinION have allowed teams to sequence in previously inaccessible locations, improving situational control and providing more accurate insights into how pathogens change over the course of outbreaks. Sequencing speed, real-time result delivery, ease of use and portability are the reasons why the MinION instrument is increasingly used for diagnostic purposes in animals, plants and other species around the world.
Sekundarne ključne besede: diagnostics;sequencing;bioinformatics;
Vrsta dela (COBISS): Diplomsko delo/naloga
Študijski program: 0
Konec prepovedi (OpenAIRE): 1970-01-01
Komentar na gradivo: Univ. v Ljubljani, Biotehniška fak., Študij biotehnologije
Strani: VI, 19 str.
ID: 13292548