Info

Blaž Stres

E-publications:

Original Scientific Article

Blaž Stres: Antibiotic-resistant soil bacteria in high-altitude (5000-6000 m) soils of the Himalaya

Blaž Stres, James M. Tiedje, Boštjan Murovec: BEsTRF

Leon Deutsch, Tadej Debevec, Grégoire P. Millet, Damjan Osredkar, Simona Konda, Robert Šket, Boštjan Murovec, Minca Mramor, Janez Plavec, Blaž Stres: Urine and Fecal [sup]1H-NMR metabolomes differ significantly between pre-term and full-term born physically fit healthy adult males

Mojca Zupanc, Barbara Brajer Humar, Matevž Dular, Jurij Gostiša, Marko Hočevar, Sabina Kolbl, Mario Krzyk, Lovrenc Novak, Jernej Ortar, Žiga Pandur, Blaž Stres, Martin Petkovšek: ǂThe ǂuse of hydrodynamic cavitation for waste-to-energy approach to enhance methane production from waste activated sludge

Nika Zajec, Blaž Stres, Gorazd Avguštin: Distinct approaches for the detection and removal of chimeric 16S rRNA sequences can significantly affect the outcome of between-site comparisons

Blaž Stres, Boštjan Murovec: Differences in melting temperatures of degenerated oligonucleotides targettingnitrous oxide reductase (nosZ) genes

Boštjan Murovec, Blaž Stres: Učinkovito kodiranje zaporedij DNA

Gemma Henderson, Faith Cox, Siva Ganesh, Arjan Jonker, Wayne Young, Peter H. Janssen, Boštjan Murovec, Blaž Stres: Rumen microbial community composition varies with diet and host, but a core microbiome is found across a wide geographical range

Boštjan Murovec, Leon Deutsch, Blaž Stres: General Unified Microbiome Profiling Pipeline (GUMPP) for large scale, streamlined and reproducible analysis of bacterial 16S rRNA data to predicted microbial metagenomes, enzymatic reactions and metabolic pathways

Leon Deutsch, Blaž Stres: ǂThe ǂimportance of objective stool classification in fecal 1H-NMR metabolomics

Boštjan Murovec, James M. Tiedje, Blaž Stres: DNA encoding for an efficient 'Omics processing

Patrick D. Schloss, Sarah L. Westcott, Thomas Ryabin, Justine R. Hall, Martin Hartmann, Emily B. Hollister, Gerhard G. Thallinger, David J. van Horn, Caroly F. Weber, Ryan A. Lesniewski, Brian B. Oakley, Donovan H. Parks, Courtney J. Robinson, Jason W. Sahl, Blaž Stres: Introducing mothur

Domen Novak, Blaž Stres, Ilja Gasan Osojnik Črnivec, Igor Škrjanec, Romana Marinšek-Logar: General microbial community flexibility in biochemical methane potential assay is highly correlated to initial biogas production rates

Nataša Ciber, Mateja Dolenc, Benjamin Drakslar, Andreja Gazvoda, Nika Klinec, Bojan Papić, Anja Pugelj, Katarina Šimunović, Tamara Zoran, Tina Zupančič, Blaž Stres: ǂThe ǂoutcomes of metabolic, molecular and physical-chemical characterization of intestinal tract microbiome on a four mammalian species model

Sabina Kolbl, Benjamin Bizjan, Vaibhav Budhiraja, Matevž Dular, Jurij Gostiša, Barbara Brajer Humar, Blaž Stres, Brane Širok, Ema Žagar, Mojca Zupanc, Anela Kaurin, Andrej Kržan, Meta Levstek, Juan Francisco Morales Arteaga, Martin Petkovšek, Gašper Rak: Integral analysis of hydrodynamic cavitation effects on waste activated sludge characteristics, potentially toxic metals, microorganisms and identification of microplastics

Boštjan Murovec, Leon Deutsch, Blaž Stres: Predictive modeling of colorectal cancer using exhaustive analysis of microbiome information layers available from public metagenomic data

Blaž Stres, Boštjan Murovec: New primer combinations with comparable melting temperatures detecting highest numbers of nosZ sequences from sequence databases

Domen Novak, Ingrid H. Franke-Whittle, Elizabeta Tratar-Pirc, Vesna Jerman, Heribert Insam, Romana Marinšek-Logar, Blaž Stres: Biotic and abiotic processes contribute to successful anaerobic degradation of cyanide by UASB reactor biomass treating brewery waste water

Sabina Kolbl, Leon Deutsch, Dragiša Savić, Franci Steinman, Bojana Danilović, Blaž Stres: ǂThe ǂimpact of crude glycerol from biodiesel production and its trace element content on biomethane production in a batch experiment

Leon Deutsch, Damjan Osredkar, Janez Plavec, Blaž Stres: Spinal muscular atrophy after nusinersen therapy

Marko Blagojevič, Mojca Zupanc, Jurij Gostiša, Blaž Stres, Alenka Šmid, Matevž Dular, Sabina Kolbl, Lidija Slemenik Perše, Urška Gradišar Centa, Benjamin Bizjan, Gašper Rak, Uroš Novak, Blaž Likozar: ǂThe ǂ impact of radicals on physicochemical properties of waste activated sludge during hydrodynamic cavitation treatment

Boštjan Murovec, Leon Deutsch, Damjan Osredkar, Blaž Stres: MetaBakery

Matevž Likar, Marjana Regvar, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres, Hermann Bothe: Diversity and seasonal variations of mycorrhiza and rhizosphere bacteria in three common plant species at the Slovenian Ljubljana Marsh

Blaž Stres, Laurent Philippot, Jadran Faganeli, James M. Tiedje: Frequent freeze-thaw cycles yield diminished yet resistant and responsive microbial communities in two temperate soils

Eva Maria Prem, Mira Mutschlechner, Blaž Stres, Paul Illmer, Andreas Otto Wagner: Lignin intermediates lead to phenyl acid formation and microbial community shifts in meso- and thermophilic batch reactors

Sabine M. Podmirseg, María Gómez-Brandón, Markus Muik, Blaž Stres, Martin Hell, Thomas Pümpel, Sudhir Murthy, Kartik Chandran, Hongkeun Park, Heribert Insam, Bernhard Wett: Microbial response on the first full-scale DEMON® biomass transfer for mainstream deammonification

Matevž Likar, Mateja Grašič, Blaž Stres, Marjana Regvar, Alenka Gaberščik: Original leaf colonisers shape fungal decomposer communities of Phragmites australis in intermittent habitats

Levin Pal, Blaž Stres, Tjaša Danevčič, Simona Leskovec, Ines Mandić-Mulec: Transformations of mineral nitrogen applied to peat soil during sequential oxic/anoxic cycling

Review Article

Sabina Kolbl, Blaž Stres: Tveganja za posameznika in okolje pri proizvodnji bioplina

Blaž Stres: ǂThe ǂfirst decade of terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) in microbial ecology

Short Scientific Article

Boštjan Murovec, Leon Deutsch, Blaž Stres: Computational framework for high-quality production and large-scale evolutionary analysis of metagenome assembled genomes

Tanja Kunej, Simon Horvat, Janez Salobir, Blaž Stres, Špela Mikec, Tomaž Accetto, Peter Dovč, Dušan Terčič, Primož Treven, Maša Vodovnik, Manja Zupan, Jaka Žgajnar, Silvester Žgur, Vida Rezar, Irena Rogelj, Mojca Simčič, Aleš Snoj, Simona Sušnik Bajec, Tanja Šumrada, Mojca Narat, Tanja Obermajer, Diana Paveljšek, Tatjana Pirman, Klemen Potočnik, Ilona Rac, Andrej Lavrenčič, Jakob Leskovec, Alenka Levart, Špela Malovrh, Romana Marinšek-Logar, Petra Mohar Lorbeg, Stane Kavčič, Ajda Kermauner, Marija Klopčič, Tina Jaklič, Milena Kovač, Aleš Kuhar, Ida Djurdjevič, Emil Erjavec, Gregor Gorjanc, Antonija Holcman, Dušanka Jordan, Luka Juvančič, Gorazd Avguštin, Bojana Bogovič Matijašić, Angela Cividini, Andreja Čanžek Majhenič, Marko Čepon, Leon Deutsch: How can we advance integrative biology research in animal science in 21st century?

Videolectures and teaching material

David Stopar, Blaž Stres, Ivan Mahne: Praktikum iz mikrobne ekologije za študente mikrobiologije

Doctoral Dissertation

Leon Deutsch, Blaž Stres: Bioinformatics integration of microbiome and metabolomics data in the translational context

Robert Šket, Blaž Stres, Tadej Debevec: Physical inactivity related changes in human fecal microbiota

Sabina Kolbl, Jože Panjan, Matjaž Mikoš, Franci Steinman, Rok Mihelič, Darko Drev, Blaž Stres: Izboljšava anaerobne presnove blata iz komunalnih čistilnih naprav in lignoceluloznih substratov pri pridobivanju bioplina

Master's Thesis

Maša Primožič, Blaž Stres: Biomarkerji človeškega črevesnega mikrobioma za napovedovanje depresije

Dean Melihen, Sabina Kolbl, Blaž Stres: Lastnosti mlekarskih odpadnih voda za pridobivanje bioplina

Petra Vidali, Blaž Stres, Martina Turk: Sestava bakterijskih združb evropskih in ameriških gorskih ledenikov

Urška Dobovišek, Blaž Stres, Tomaž Accetto, Aleksander Mahnič: Optimizacija metod za osamitev sporogenih bakterij iz fecesa človeka

Bojan Papić, Blaž Stres, Lejla Pašić, Blagajana Herzog-Velikonja: Biotehnološki potencial metagenomskih knjižnic iz mikrobnih skupnosti kraških jam

Monika Pušić, Maja Rupnik, Blaž Stres, Martin Sievers: Detection of potential actinobacterial inhibitors of bacterium Clostridium difficile Mur ligases

Elmedine Rustemi, Maja Rupnik, Blaž Stres, Martin Sievers: Antimicrobial potential of actinobacterial inhibitors of MurA and MurB ligases in bacterium Clostridium difficile

Vladimir Grujić, Blaž Stres, Hrvoje Petković, Antonio Starcevic: Application of antiSMASH tool for identification and analysis of type II polyketide gene clusters

Jerca Bajuk, Bojana Bogovič Matijašić, Blaž Stres: Metaanaliza podatkov o humani mikrobioti

Domen Zavec, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres: Fizikalno-kemijski parametri in struktura mikrobnih združb ob zagonu industrijskih bioplinskih anaerobnih reaktorjev

Aleksandar Sebastijanović, Tomaž Accetto, Blaž Stres, Zala Prevoršek: Taksonomska analiza metagenomov in raznovrstnost rastlinskih polimerov kot hranil za mikrobne združbe v vampu prostoživečih prežvekovalcev

Deni Košeto, Tomaž Accetto, Blaž Stres, Boštjan Murovec: Funkcionalna analiza metagenomov in rutinska identifikacija rastlinskih polimerov med fermentacijo v vampu prostoživečih prežvekovalcev

Tjaša Cesar, Marjetka Suhadolc, Matevž Likar, Matevž Likar, Blaž Stres, Mojca Narat, Marjetka Suhadolc, Blaž Stres: Preučevanje bakterijskih in glivnih združb tal v vinogradih z ekološko pridelavo grozdja

Arijana Filipić, Bojana Bogovič Matijašić, Blaž Stres: Vpliv mirovanja na mikrobioto prebavnega trakta ljudi

Leon Deutsch, Hrvoje Petković, Blaž Stres, Sabina Kolbl: Računska optimizacija izplena metana pridobljenega v semikontinuirani anaerobni razgradnji

Urška Skamen, Blaž Stres, Marjanca Starčič Erjavec, Nataša Mori: Mikrobna združba sedimentov reke Kamniške Bistrice in frekvenca konjugacijskega prenosa

Eva Weber, Blaž Stres, Ines Mandić-Mulec, James Ivor Prosser: Ammonium sources for archaeal and bacterial ammonia oxidisers

Doroteja Vlaj, Blaž Stres, Anja Klančnik, Maja Paš: Izolacija aktinomicet iz slovenskih kraških jam in vrednotenje njihove protimikrobne aktivnosti

Urban Kavčič, Blaž Stres, Aleš Podgornik, Štefan Starčević: Vpeljava procesne analitične tehnologije v bioprocese s sesalskimi celicami

Eva Stare, Blaž Stres, Tomaž Accetto: Metagenomske vrste prevotel v prebavnih ekosistemih

Tajda Bogataj, Tomaž Accetto, Blaž Stres, Heribert Insam: Use of black soldier fly (Hermetia illucens) for protein production from organic wastes and its microbiome

Simona Konda, Rok Kostanjšek, Blaž Stres, Tadej Debevec: Spremembe metabolitov in mikrobnega okolja v prebavilih pred in po normoksični in hipoksični obremenitvi

Undergraduate Thesis

Doroteja Repič, David Stopar, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres: Aktivnost in številčnost mikrobne združbe v različnih globinah barjanskih tal

Nadja Robič, Polona Zalar, Blaž Stres, Janez Mulec: Analiza bakterijske združbe in sedimentov štirih nepovezanih jamskih sistemov

Andraž Godicelj, Tomaž Accetto, Blaž Stres: Vpliv prostih nukleinskih kislin na zaznavanje strukture in aktivnosti mikrobnih združb

Blaž Jesenko, Blaž Stres, Marjanca Starčič Erjavec, Darja Žgur-Bertok: Razlikovanje izolatov bakterije Escherichia coli iz blata zdravih ljudi z metodo ERIC-PCR

Iva Lipovšek, Marjetka Suhadolc, Blaž Stres, Vesna Jerman: Bioinformatska in molekularna analiza parametrov variabilnosti tehnik pri analizi strukture mikrobnih združb

Nika Zajec, Gorazd Avguštin, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres: Vpliv okoljskih dejavnikov na aktivnost in pestrost mikrobne združbe v barjanskih tleh

Ajda Medjedović, Blaž Stres, Romana Marinšek-Logar: Vpliv različnih pivovarskih odpadkov na proizvodnjo bioplina z granuliranim muljem iz UASB bioreaktorja

Levin Pal, Gorazd Avguštin, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres: Aktivnost in struktura denitrifikatorjev v tleh Ljubljanskega barja

Saša Jandrić, Tjaša Danevčič, Blaž Stres: Oksigenazna aktivnost metagenomskih klonov in statistična analiza parametrov uspešnosti ekspresije obstoječih metagenomskih knjižnic

Tina Zakotnik, Gorazd Avguštin, Blaž Stres: Sestava in aktivnost bakterijskih mikrobnih združb v sedimentih Postojnske jame starih do 700.000 let

Tamara Odar, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres: Aktivnost in struktura bakterijskih mikrobnih združb v ledeniških sedimentih (Spitzbergen, Svalbard, Norveška) v odvisnosti od okoljskih dejavnikov

Lara Resman, Gorazd Avguštin, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres: Vpliv dejavnikov okolja na dinamiko nitrifikatorjev in na emisije toplogrednih plinov v mikrokozmih tal Ljubljanskega barja

Miha Žitnik, Blaž Stres, Romana Marinšek-Logar, Aleš Lapanje: Identifikacija pritrjenih in planktonskih bakterijskih vrst v dolomitnem vodonosniku

Barbara Blažič, Gorazd Avguštin, Blaž Stres, Tomaž Accetto: Razvoj genetskih orodij za pripravo metagenomskih knjižnic industrijsko pomembnih encimov

Rok Lenarčič, David Stopar, Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres: Bioremediacijski potencial šotnih tal

Treatise, Preliminary Study, Study

V. Grüntzig, Blaž Stres, H. L. Ayala del Río, James M. Tiedje: Improved protocol for T-RFLP by capillary electrophoresis

Other Monographs and Other Completed Works

Franc Ločniškar, Blaž Stres, Tanja Kunej, Blaž Stres, Tanja Kunej: Zdravje živali in spremljanje kazalnikov zdravja živali

Proceedings of Professional or Unreviewed Scientific Conference Contributions

Ines Mandić-Mulec, Blaž Stres, Tjaša Danevčič: COST action 856