magistrsko delo
Tadeja Poljanšek (Avtor), Irena Golinar (Mentor), Irena Golinar (Član komisije za zagovor), Mojca Narat (Član komisije za zagovor), Uroš Rajčević (Član komisije za zagovor)

Povzetek

Mikoplazme so najmanjši in najpreprostejši prokarionti, ki pogosto okužijo celične kulture v laboratoriju in vplivajo na fiziologijo in metabolizem evkariontskih celic. Z različnimi testi, ki so vključevali PCR, barvanje DNA in komercialne teste, smo preverili prisotnost mikoplazem v celičnih kulturah v našem laboratoriju. Izkazalo se je, da je kar nekaj najpogosteje uporabljenih celičnih linij okuženih z mikoplazmami. Ker nas je zanimalo, s katero vrsto mikoplazem so okužene, smo pomnoženo zaporedje ribosomalne DNA mikoplazem sekvencirali in primerjali s sekvencami že znanih mikoplazem. Ugotovili smo, da so preverjene celične kulture okužene z Mycoplasma hyorhinis. Mikoplazme smo iz okuženih kultur poskusili odstraniti z dodatkom antibiotika gentamicina, ki smo ga dodali v visoki koncentraciji direktno v celično gojišče, vendar so celice ostale okužene, saj je M. hyorhinis nanj verjetno odporna. Za najbolj uporabno metodo detekcije mikoplazem v celičnih kulturah se je izkazala verižna reakcija s polimerazo, saj je bila najbolj zanesljiva in cenovno primerna, hkrati pa preprosta in primerna za analizo več vzorcev naenkrat.

Ključne besede

mikoplazme;Mollicutes;celične linije;celične kulture;okužba;testiranje okuženosti;Mycoplasma hyorhinis;PCR;Hoechst 33342;sekvenciranje;zdravljenje;okužene linije;

Podatki

Jezik: Slovenski jezik
Leto izida:
Tipologija: 2.09 - Magistrsko delo
Organizacija: UL BF - Biotehniška fakulteta
Založnik: [T. Poljanšek]
UDK: 602.3:579.887:576.32/.36:579.24:57.086(043.2)
COBISS: 18059779 Povezava se bo odprla v novem oknu
Št. ogledov: 524
Št. prenosov: 149
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Angleški jezik
Sekundarni naslov: Comparison of tests for mycoplasma detection in cell cultures
Sekundarni povzetek: Mycoplasmas are the smallest and simplest prokaryotes, which often infect cell cultures in laboratories and have an effect on their physiology and metabolism. We used different tests, including PCR, DNA staining and commercial kits, to inspect our cell cultures for mycoplasma contamination. We have shown, that some of our most frequently used cell cultures are contaminated with mycoplasmas. To find out the species of contaminating mycoplasmas, we used sequencing and compared our sequence to known species. All checked cell cultures were contaminated with Mycoplasma hyorhinis. To eradicate the contamination, we added antibiotic gentamycin in high concentration directly to the cell medium, but the cells remained mycoplasma contaminated, probably due to antibiotic resistance. The Polymerase chain reaction turned out to be the most useful method for detection of mycoplasmas in cell culture because of its reliability, price, simplicity and possibility of analysing more samples at the same time.
Sekundarne ključne besede: mycoplasma;cell lines;cell cultures;mycoplasma contamination;contamination detection;sequencing;elimination treatments;
Vrsta dela (COBISS): Magistrsko delo/naloga
Študijski program: 0
Konec prepovedi (OpenAIRE): 1970-01-01
Komentar na gradivo: Univ. v Ljubljani, Biotehniška fak., Študij biotehnologije
Strani: X, 57 f., [4] f. pril.
ID: 11411832