magistrsko delo
Anja Trupej (Avtor), Jernej Ogorevc (Mentor), Miha Modic (Komentor)

Povzetek

Jedrce, biomolekularni kondenzat, je ključnega pomena pri sintezi sestavnih RNA ribosomskih komponent in glavno mesto zorenja ribosomov. Težnja po količini proteinov se spreminja tekom celične diferenciacije. Embionalne matične celice (EMC) za ohranjanje razvojne plastičnosti in zagotavljanja zadostnega števila predniških celic zahtevajo večje količine proteinov kot somatske celice. Sorazmerno s količino proteinov narašča tudi število zrelih ribosomov, ki so rezultat večjega števila aktivno prepisanih ribosomskih genov (rDNA) v jedrcu. Pomanjkanje raziskav na področju prekurzorskih ribosomskih molekul RNA (pre-rRNA) v delečih se EMC preprečuje celostno razumevanje njihove dinamike in vrednotenja pomena pri vzdrževanju pluripotentnosti. Za uporabo različnih metod vizualizacije tarčnih molekul pre-rRNA v mišjih EMC se je hibridizacijski pristop izkazal za najprimernejšega. S slednjim smo odkrili dosedaj neopažene kondenzate v središču mitotskih kromosomov in uspeli dokazati njihovo prostorsko ujemanje z novo nastajajočimi molekulami RNA. Vpogled v interakcijsko mrežo molekul RNA mitotskega kondenzata nam je omogočila tehnika označevanja okolice tarčnih RNA, HyPro, s katero smo identificirali številne majhne RNA v jedrcu (snoRNA) udeležene v procesu zorenja pre-rRNA. Prostorska prepletenost prekurzorskih ribosomskih prepisov RNA in snoRNA, pri kateri izstopa snord3b-ps2, kaže na novo funkcijo ribosomskih genov v delečih se EMC in zamaje temelje dosedanjih prepričanj o pomenu mitotskih prepisov pre-rRNA.

Ključne besede

biotehnologija;jedrce;prekurzorsko ribosomska RNA;embrionalne matične celice;mitotski kondenzati;CRISPR-dCas13d;HyPro;

Podatki

Jezik: Slovenski jezik
Leto izida:
Tipologija: 2.09 - Magistrsko delo
Organizacija: UL BF - Biotehniška fakulteta
Založnik: [A. Trupej]
UDK: 601.4:577.21(043.2)
COBISS: 125876483 Povezava se bo odprla v novem oknu
Št. ogledov: 18
Št. prenosov: 10
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Angleški jezik
Sekundarni naslov: Cell cycle dynamics of pre-rRNA nucleolar compartmentaliziation in embryonic stem cells
Sekundarni povzetek: The biomolecular condensate nucleolus has a significant role in synthesis of ribosomal RNA components and represents the base of ribosome biogenesis in cells. During cell differentiation the demands for proteins are changing. Embryonic stem cells (ESCs) known for their developmental plasticity and high division rate show tendency to greater amount of proteins compare to somatic cells. Equivalently to protein amount quantity of functional ribosomes also rises through increased number of actively transcribed ribosomal genes or rDNA in nucleolus. Shortage of studies regarding dynamics of precursors of ribosomal RNA molecules (pre-rRNA) in dividing ESCs prevents a wholesome understanding and assessment of their role in relation to cell’s pluripotency. In the process of applying various methods for labeling target pre-rRNA molecules in mouse ESC the hybridization technique stood out as the most suitable one. With it we discovered never seen before condensates within mitotic chromosomes and were able to prove their spatial overlap with mitotic transcription sites of nascent RNAs. Conducting proximitiy labeling technique HyPro we got insight into interaction hubs of RNAs in mitotic condensates and identified multiple snoRNAs involved in process of maturating pre-rRNAs. Spatial entanglement of precursors of ribosomal RNAs and snoRNAs, outstanding snord3b-ps2, suggests new function of ribosomal genes in dividng ESCs and shakes the foundation on which meaning of mitotic pre-rRNAs was build.
Sekundarne ključne besede: biotechnology;nucleolus;precursor of ribosomal RNA;embryonic stem cells;mitotic condensates;
Vrsta dela (COBISS): Magistrsko delo/naloga
Študijski program: 0
Konec prepovedi (OpenAIRE): 1970-01-01
Komentar na gradivo: Univ. v Ljubljani, Biotehniška fak., Študij biotehnologije
Strani: 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XI, 79 f.))
ID: 16525488