magistrsko delo
Urška Hostnik (Avtor), Tatjana Pirman (Recenzent), Simon Horvat (Mentor), Tanja Kunej (Komentor)

Povzetek

Nalaganje maščevja je kompleksna lastnost, na katero med drugim vplivajo številni okoljski dejavniki in genetske razlike med posamezniki. Za preučevanje genetskih dejavnikov so najbolj primerni mišji poligeni modeli. V našem postopku smo uporabili liniji, ki sta bili selekcionirani na visok (debela linija) ali nizek (vitka linija) odstotek telesnega maščevja. Prejšnje študije so nakazale, da je gen Pla2g4e eden od potencialnih kandidatnih genov, ki lahko razloži del fenotipske razlike med linijama. Zato smo si kot prvi cilj zadali analizo izražanja Pla2g4e v hipotalamusu med vitko in debelo linijo, ki sta bili krmljeni s krmama z različno vsebnostjo maščob. Dokazali smo statistično značilno povišano izražanje gena v hipotalamusu debele linije miši, ne glede na vrsto krme. Drugi cilj je bil okarakterizirati gen Pla2g4e s sodobnimi bioinformacijskimi metodami, predvsem z vidika identifikacije polimorfizmov med vitko in debelo linijo, ki bi bili lahko odgovorni za diferencialno izražanje. Pri debeli liniji smo našli polimorfizme, zaradi katerih se lahko izgubijo vezavne regije za miRNA in transkripcijski represor CTCF, kar predvidevamo, da lahko pri tej liniji vodi v povišano izražanje gena Pla2g4e in posledično povišano raven nalaganja telesne maščobe. Pridobljeni rezultati kažejo, kako pomembno je genetsko ozadje pri debelosti in predstavljajo osnovo za razvoj potencialnih novih biooznačevalcev za nalaganje maščobe.

Ključne besede

genetika;geni;Pla2g4e;izražanje genov;nalaganje telesne maščobe;biooznačevalci;laboratorijske miši;poligeni modeli;vitka linija;debela linija;magistrska dela;

Podatki

Jezik: Slovenski jezik
Leto izida:
Tipologija: 2.09 - Magistrsko delo
Organizacija: UL BF - Biotehniška fakulteta
Založnik: [U. Hostnik]
UDK: 575(043.2)
COBISS: 145320451 Povezava se bo odprla v novem oknu
Št. ogledov: 38
Št. prenosov: 12
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Angleški jezik
Sekundarni naslov: Analysis of the Pla2g4e candidate gene in the lean and fat mouse lines fed with a high or low fat diet
Sekundarni povzetek: Fat accumulation is a complex trait influenced by many environmental factors and genetic differences between individuals. Mouse polygenic models are best suited to study genetic factors. In our experiment, we used two lines selected for high (fat line) or low (lean line) body fat percentage. Previous studies have suggested that the gene Pla2g4e is one of the potential candidate genes that may explain part of the phenotypic difference between the lines. Therefore, as a first aim, we set out to analyse the expression of Pla2g4e in the hypothalamus between the lean and fat lines that were fed diets containing different levels of fat. We demonstrated a statistically significant increased gene expression in the hypothalamus of the obese mouse line, irrespective of the diet type or sex. The second objective was to characterise the gene Pla2g4e using bioinformatics methods with the objective of identifying polymorphisms between the lean and the obese lines that might be responsible for the differential expression. In the obese line, we found polymorphisms that may result in a loss of binding regions for miRNA and the transcriptional repressor CTCF, which we hypothesise may lead to increased expression of the gene Pla2g4e and consequently increased levels of body fat deposition in this line. These results demonstrate the importance of genetic background in obesity and provide a basis for the development of potential new biomarkers for fat deposition.
Sekundarne ključne besede: genetics;genes;Pla2g4e;gene expression;body fat deposition;biomarkers;laboratory mice;mouse polygenic models;lean line;fat line;
Vrsta dela (COBISS): Magistrsko delo/naloga
Študijski program: 0
Konec prepovedi (OpenAIRE): 1970-01-01
Komentar na gradivo: Univ. v Ljubljani, Biotehniška fak., Oddelek za zootehniko, Magistrsko delo magistrskega študijskega programa 2. stopnje Znanost o živalih
Strani: 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XIII, 67 str., [2] str. pril.))
ID: 18019758