master's thesis
Rok Breznikar (Avtor), Tomaž Urbič (Mentor), Helena Prosen (Član komisije za zagovor), Črtomir Podlipnik (Član komisije za zagovor), Birger Dittrich (Komentor)

Povzetek

In this work we gathered reliable 3D information of solid-state structures to provide this information for, in principle, any molecule. The source of this information was a large database of experimental 3D structures, mostly determined using single-crystal X-ray diffraction (SC-XRD). A subset of these structures was also optimised via semiempirical quantum mechanical structure optimisation to get reliable information for hydrogen positions. 3D structure analysis was done by expanding the idea of invarioms and incorporating it in a program called BAERLAUCH via C/C++ code development. The result is a string notation capable of capturing 3D structure of a molecule.

Ključne besede

molecular file formats;conformer generation;quantum chemistry;

Podatki

Jezik: Angleški jezik
Leto izida:
Tipologija: 2.09 - Magistrsko delo
Organizacija: UL FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Založnik: [R. Breznikar]
UDK: 544.1(043.2)
COBISS: 222892803 Povezava se bo odprla v novem oknu
Št. ogledov: 57
Št. prenosov: 19
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Slovenski jezik
Sekundarni naslov: Kemoinformatika z vrstičnim zapisom Invariom
Sekundarni povzetek: V tej magistrski nalogi smo zbrali zanesljive 3D informacije o strukturah v trdnem stanju, da lahko te informacije zagotovimo za, v principu, katero koli molekulo. Vir teh informacij je bila obsežna zbirka eksperimentalnih 3D struktur, večinoma določenih z uporabo rentgenske difrakcije na monokristalu (SC-XRD). Del teh struktur je bil tudi optimiziran z uporabo semiempirične kvantnomehanske strukturne optimizacije, da smo pridobili zanesljive informacije o položajih vodikovih atomov. Analiza 3D strukture je bila opravljena z razširjanjem ideje o invariomih in njeno vključitvijo v program BAERLAUCH preko razvoja C/C++ kode. Rezultat je vrstični zapis, ki omogoča zajemanje 3D strukture molekule.
Sekundarne ključne besede: zapis molekul;generiranje konformerjev;3D struktura;rentgenska difrakcija;invariomi;magistrska dela;Kvantna kemija;Kemična sestava;Univerzitetna in visokošolska dela;
Vrsta dela (COBISS): Magistrsko delo/naloga
Študijski program: 1000375
Konec prepovedi (OpenAIRE): 1970-01-01
Komentar na gradivo: Univ. v Ljubljani, Fak. za kemijo in kemijsko tehnologijo, smer Kemija
Strani: 1 spletni vir (1 datoteka PDF (44 str.))
ID: 25632842