doktorska disertacija
Maja Vodopivec (Avtor), Mojca Narat (Mentor), Tomaž Curk (Komentor)

Povzetek

Temelj biofarmacevtike je proizvodnja terapevtskih učinkovin s pomočjo živih organizmov, pri čemer veliko pozornosti posvečamo uravnavanju kakovosti pridobljenega produkta. Eden najpomembnejših atributov kakovosti monoklonskih protiteles (mAb) je fukozilacija, saj močno vpliva na reakcijo celično posredovane citotoksičnosti (ADCC) pri pacientih. Fukozilacijo mAb uravnavamo s spreminjanjem pogojev gojenja rekombinantne celične linije, s čimer usmerjamo celični metabolizem v želeno smer procesiranja produkta. Namen doktorskega dela je bil poglobiti razumevanje celičnega procesa fukozilacije v trajni celični liniji ovarijskih celic kitajskega hrčka (CHO), ki se v biofarmacevtski industriji najpogosteje uporabljajo za proizvodnjo bioloških zdravil. Med bioprocesom z dohranjevanjem smo merili znotrajcelične metabolite in opravili bioinformacijske analize metabolomskih podatkov. Izvedli smo petnajst 14-dnevnih bioprocesov z dohranjevanjem, pri katerih smo poleg zunajceličnih metabolitov izolirali in merili tudi znotrajcelične metabolite, ki sestavljajo metabolom. Metabolomske podatke smo analizirali s kombinacijo univariantne in multivariantne statistike ter specializiranih bioinformacijskih pristopov. Uspešno smo opredelili štiri različne metabolne faze bioprocesa z dohranjevanjem ter poiskali nabor znotrajceličnih metabolitov, ki se statistično značilno razlikujejo med standardnim bioprocesom z dohranjevanjem in tistim, ki je bil optimiziran za pridobivanje večjega deleža fukoziliranih mAb. Tako smo na podlagi izvedenih eksperimentov in bioinformacijskih analiz izboljšali razumevanje metabolnih procesov, ki potekajo v celicah CHO med bioprocesom z dohranjevanjem, in raziskali pogoje, ki omogočajo pridobivanje različno fukoziliranih mAb.

Ključne besede

bioprocesi;bioinformatika;bioinformacijska analiza;metabolomika;fukozilacija;celice CHO;monoklonska protitelesa;bioproces z dohranjevanjem;biološka zdravila;doktorska disertacija;

Podatki

Jezik: Slovenski jezik
Leto izida:
Tipologija: 2.08 - Doktorska disertacija
Organizacija: UL BF - Biotehniška fakulteta
Založnik: [M. Lipovšek]
UDK: 602.4:615:577(043.3)
COBISS: 229786627 Povezava se bo odprla v novem oknu
Št. ogledov: 109
Št. prenosov: 50
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Angleški jezik
Sekundarni naslov: Metabolic profile analysis of CHO culture during fed batch process to support modulation of recombinant monoclonal antibody fucosylation
Sekundarni povzetek: Since production of therapeutics with the help of living organisms is the core of biopharmaceuticals, a lot of attention must be paid to regulating the quality of the obtained product. One of the most important quality attributes of recombinant monoclonal antibodies (mAb) is fucosylation, which strongly influences the cell-mediated cytotoxicity response (ADCC) in patients. The degree of mAb fucosylation can be regulated during the upstream production process, by varying the culture conditions, and thereby directing cellular metabolism towards the desired product quality. The goal of the doctoral thesis was to deepen the understanding of cellular metabolism of CHO culture during fed-batch to support modulation of mAb fucosylation by the means of bioinformatics analysis of metabolomics data. Metabolomic data were analyzed with a mixture of univariate and multivariate statistics and specialized bioinformation approaches, that enabled identification of four different metabolic phases during fed-batch, as well as the list of metabolites that were differed significantly between the standard bioprocess and the one, which was optimized to obtain a higher degree of fucosylated mAbs. We have thus improved the understanding of metabolic processes that take place within the CHO cells during the fed-batch bioprocess and found conditions that allow the production of mAbs with varying degree of fucosylation.
Sekundarne ključne besede: bioprocesses;bioinformatics;bioinformatics analysis;metabolomics;fucosylation;CHO;monoclonal antibody;fed-batch;fed batch;biologics;
Vrsta dela (COBISS): Doktorsko delo/naloga
Študijski program: 0
Komentar na gradivo: Univ. v Ljubljani, Biotehniška fak.
Strani: 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XVI, 109, [2] str.))
ID: 26088673