Nacionalni portal odprte znanosti
Dostop do znanja slovenskih raziskovalnih organizacij
Domov
Napredno iskanje
Brskanje
Digitalna knjižnica Univerze v Mariboru
Repozitorij Univerze v Ljubljani
Repozitorij Univerze na Primorskem
Repozitorij Univerze v Novi Gorici
DiRROS
REVIS
Statistika
Digitalna knjižnica Univerze v Mariboru
Repozitorij Univerze v Ljubljani
Repozitorij Univerze na Primorskem
Repozitorij Univerze v Novi Gorici
DiRROS
REVIS
Mobilno
Odprti podatki
O projektu
Kontakt
Iskalni niz:
išči po
Naslov
Avtor
Opis
Ključne besede
Polno besedilo
Leto
ALI
IN
IN NE
išči po
Naslov
Avtor
Opis
Ključne besede
Polno besedilo
Leto
ALI
IN
IN NE
išči po
Naslov
Avtor
Opis
Ključne besede
Polno besedilo
Leto
ALI
IN
IN NE
išči po
Naslov
Avtor
Opis
Ključne besede
Polno besedilo
Leto
Vrsta gradiva:
Ni določena
Izvirni znanstveni članek
Pregledni znanstveni članek
Kratki znanstveni prispevek
Strokovni članek
Poljudni članek
Objavljeni znanstveni prispevek na konferenci (vabljeno predavanje)
Objavljeni strokovni prispevek na konferenci (vabljeno predavanje)
Objavljeni znanstveni prispevek na konferenci
Objavljeni strokovni prispevek na konferenci
Objavljeni povzetek znanstvenega prispevka na konferenci (vabljeno predavanje)
Objavljeni povzetek znanstvenega prispevka na konferenci
Objavljeni povzetek strokovnega prispevka na konferenci
Samostojni znanstveni sestavek ali poglavje v monografski publikaciji
Samostojni strokovni sestavek ali poglavje v monografski publikaciji
Geslo – sestavek v enciklopediji, leksikonu, slovarju...
Recenzija, prikaz knjige, kritika
Predgovor, spremna beseda
Polemika, diskusijski prispevek
Intervju
Umetniški sestavek
Bibliografija, kazalo ipd.
Drugi članki ali sestavki
Znanstvena monografija
Strokovna monografija
Univerzitetni, visokošolski ali višješolski učbenik z recenzijo
Srednješolski, osnovnošolski ali drugi učbenik z recenzijo
Video in druga učna gradiva
Enciklopedija, slovar, leksikon, priročnik, atlas, zemljevid
Bibliografija
Doktorska disertacija
Magistrsko delo
Specialistično delo
Diplomsko delo
Končno poročilo o rezultatih raziskav
Elaborat, predštudija, študija
Projektna dokumentacija (idejni projekt, izvedbeni projekt)
Izvedensko mnenje, arbitražna odločba
Umetniško delo
Katalog razstave
Raziskovalni ali dokumentarni film, zvočni ali video posnetek
Radijska ali televizijska oddaja
Raziskovalni podatki
Programska oprema
Nova sorta
Patentna prijava
Patent
Druge monografije in druga zaključena dela
Znanstveni terminološki slovar, enciklopedija ali tematski leksikon
Zbornik strokovnih ali nerecenziranih znanstvenih prispevkov na konferenci
Zbornik recenziranih znanstvenih prispevkov na mednarodni ali tuji konferenci
Zbornik recenziranih znanstvenih prispevkov na domači konferenci
Umetniška poustvaritev
Radijski ali TV dogodek
Razstava
Organiziranje znanstvenih in strokovnih sestankov
Predavanje na tuji univerzi
Prispevek na konferenci brez natisa
Vabljeno predavanje na konferenci brez natisa
Druga dela
Druga izvedena dela
Vse
Jezik:
Slovenski jezik
Angleški jezik
Hrvaški jezik
Nemški jezik
Srbski jezik (cirilica)
Srbski jezik
Madžarski jezik
Nemški jezik (Avstrija)
Italijanski jezik
Francoski jezik
Neznan jezik
Polski jezik
Češki jezik
Slovaški jezik
Slovenski jezik
Angleški jezik
Vse
Prikaži samo zadetke s polnim besedilom
Št. zadetkov: 7
Guidelines for the reliable use of high throughput sequencing technologies to detect plant pathogens and pests
Sébastien Massart
,
Ian Adams
,
Maher Al Rwahnih
,
Steve Baeyen
,
Guillaume J. Bilodeau
,
Arnaud G. Blouin
,
Neil Boonham
,
Thierry Candresse
,
Anne Chandellier
,
Kris De Jonghe
,
Denis Kutnjak
,
Nataša Mehle
Pregledni znanstveni članek
Oznake: bolezni rastlin;rastlinski virusi;rastlinski patogeni;rastlinski škodljivci;sekvenciranje;
High-throughput sequencing (HTS) technologies have the potential to become one of the most significant advances in molecular diagnostics. Their use by researchers to detect and characterize plant pathogens and pests has been growing steadily for more than a decade and they are now envisioned as a ro ...
Leto: 2022
Vir: Nacionalni inštitut za biologijo (NIB)
Biological and genetic characterization of Physostegia chlorotic mottle virus in Europe based on host range, location, and time
Coline Temple
,
Arnaud G. Blouin
,
Kris De Jonghe
,
Yoika Foucart
,
Marleen Botermans
,
Marcel Westenberg
,
Ruben Schoen
,
Pascal Gentit
,
Michèle Visage
,
Eric Verdin
,
Mark Paul Selda Rivarez
,
Denis Kutnjak
,
Ana Vučurović
Izvirni znanstveni članek
Oznake: biološka karakterizacija;genetska karakterizacija;PhCMoV;rastlinski virusi;
Application of high throughput sequencing (HTS) technologies enabled the first identification of Physostegia chlorotic mottle virus (PhCMoV) in 2018 in Austria. Subsequently, PhCMoV was detected in Germany and Serbia on tomatoes showing severe fruit mottling and ripening anomalies. We report here ho ...
Leto: 2022
Vir: Nacionalni inštitut za biologijo (NIB)
Looking beyond virus detection in RNA sequencing data
Annelies Haegeman
,
Yoika Foucart
,
Kris De Jonghe
,
Thomas Goedefroit
,
Maher Al Rwahnih
,
Neil Boonham
,
Thierry Candresse
,
Yahya Gaafar
,
Oscar Hurtado-Gonzales
,
Zala Kogej
,
Denis Kutnjak
,
Janja Lamovšek
,
Irena Mavrič Pleško
Izvirni znanstveni članek
Oznake: rastlinski patogeni;diagnostika;sekvenciranje;metagenomika;metatranskriptomatika;plant viruses;plant virus detection;plant virology;high-throughput sequencing;RNA sequencing;plant tissues;plant pathogen;diagnostics;metagenomics;metatranscriptomics;
High-throughput sequencing (HTS), more specifically RNA sequencing of plant tissues, has become an indispensable tool for plant virologists to detect and identify plant viruses. During the data analysis step, plant virologists typically compare the obtained sequences to reference virus databases. In ...
Leto: 2023
Vir: Nacionalni inštitut za biologijo (NIB)
Validation of molecular tests for the detection of tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) in seed of tomato and pepper
Anne Giesbers
,
Annelien J. W. Roenhorst
,
Martijn Schenk
,
Ruud Barnhoorn
,
Laura Tomassoli
,
Marta Luigi
,
Kris De Jonghe
,
Laëtitia Porcher
,
Pascal Gentit
,
Heiko Ziebell
,
Mouhammad Zeidan
,
Dorit Shargil
,
Sabine Grausgruber Groeger
,
Nataša Mehle
Končno poročilo o rezultatih raziskav
Oznake: virus rjave grbančavosti plodov paradižnika;medlaboratorijska primerjava testov;semena;
Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) is a relatively recently described tobamovirus (Salem et al., 2016) causing problems in tomato and pepper cultivation worldwide (Luria et al., 2017, Salem et al., 2019). ToBRFV has been reported to cause yellow spots, green spots, necrotic lesions and occasio ...
Leto: 2021
Vir: Nacionalni inštitut za biologijo (NIB)
Interlaboratory comparison study on ribodepleted total RNA high-throughput sequencing for plant virus diagnostics and bioinformatic competence
Yahya Gaafar
,
Marcel Westenberg
,
Marleen Botermans
,
László Krizbai
,
Kris De Jonghe
,
Yoika Foucart
,
Luca Ferretti
,
Denis Kutnjak
,
Anja Pecman
,
Nataša Mehle
,
Jan F. Kreuze
,
Giovanna Müller
,
Nikolaos Vakirlis
,
Despoina Beris
,
Christina Varveri
,
Heiko Ziebell
Izvirni znanstveni članek
Oznake: high-throughput sequencing;ribodepletion;interlaboratory comparison;test performance study;proficiency test;Virtool;
High-throughput sequencing (HTS) technologies and bioinformatic analyses are of growing interest to be used as a routine diagnostic tool in the field of plant viruses. The reliability of HTS workflows from sample preparation to data analysis and results interpretation for plant virus detection and i ...
Leto: 2021
Vir: Nacionalni inštitut za biologijo (NIB)
ǂA ǂprimer on the analysis of high-throughput sequencing data for detection of plant viruses
Denis Kutnjak
,
Lucie Tamisier
,
Ian Adams
,
Neil Boonham
,
Thierry Candresse
,
Michela Chiumenti
,
Kris De Jonghe
,
Jan F. Kreuze
,
Marie Lefebvre
,
Goncalo Silva
,
Martha Malapi-Wight
,
Paolo Margaria
,
Irena Mavrič Pleško
,
Sam McGreig
,
Laura Miozzi
,
Benoit Remenant
,
Jean-Sébastien Reynard
,
Johan Rollin
,
Mike Rott
,
Olivier Schumpp
,
Sébastien Massart
,
Annelies Haegeman
Pregledni znanstveni članek
Oznake: varstvo rastlin;rastlinski virus;bioinformatika;mikroorganizmi;zaznavanje;odkritje;plant virus;high-throughput sequencing;bioinformatics;detection;discovery;
High-throughput sequencing (HTS) technologies have become indispensable tools assisting plant virus diagnostics and research thanks to their ability to detect any plant virus in a sample without prior knowledge. As HTS technologies are heavily relying on bioinformatics analysis of the huge amount of ...
Leto: 2021
Vir: Nacionalni inštitut za biologijo (NIB)
ǂA ǂset of experimentally validated decoys for the human CC chemokine receptor 7 (CCR7) obtained by virtual screening
Matic Proj
,
Steven De Jonghe
,
Tom Van Loy
,
Marko Jukič
,
Anže Meden
,
Luka Ciber
,
Črtomir Podlipnik
,
Uroš Grošelj
,
Janez Konc
,
Dominique Schols
,
Stanislav Gobec
Izvirni znanstveni članek
Oznake: virtual screening;decoys;chemical library;computer-aided drug design;CCR7;GPCR;
We present a state-of-the-art virtual screening workflow aiming at the identification of novel CC chemokine receptor 7 (CCR7) antagonists. Although CCR7 is associated with a variety of human diseases, such as immunological disorders, inflammatory diseases, and cancer, this target is underexplored in ...
Leto: 2022
Vir: Fakulteta za farmacijo (UL FFA)
Št. zadetkov: 7
Ključne besede:
high-throughput sequencing (3)
rastlinski patogeni (2)
rastlinski virusi (2)
sekvenciranje (2)
bioinformatics (1)
bioinformatika (1)
biološka karakterizacija (1)
Leto izdaje:
2021 (3)
2022 (3)
2023 (1)
Avtorji:
De Jonghe Kris (6)
Kutnjak Denis (5)
Boonham Neil (3)
Candresse Thierry (3)
Foucart Yoika (3)
Mehle Nataša (3)
Adams Ian (2)
Repozitorij:
Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije (6)
Repozitorij Univerze v Ljubljani (RUL) (1)
Tipologija:
Izvirni znanstveni članek (4)
Pregledni znanstveni članek (2)
Končno poročilo o rezultatih raziskav (1)
Jezik:
Angleški jezik (7)