Št. zadetkov: 49
Izvirni znanstveni članek
Oznake:
bioinformatics workflow;clinical metagenomics;long reads;pathogen detection;short PE reads;
Over the past decade, there have been many improvements in the field of metagenomics, including sequencing technologies, advances in bioinformatics and the development of reference databases, but a one-size-fits-all sequencing and bioinformatics pipeline does not yet seem achievable. In this study, ...
Leto:
2024
Vir:
Medicinska fakulteta (UL MF)
Video in druga učna gradiva
Oznake:
medicine
Virus Ebola je v zahodni Afriki zahteval več kot 11.000 življenj ter imel usoden družbeni in gospodarski vpliv. Epidemija se je začela s smrtjo 2-letnega dečka, ki se je okužil ob stiku z okuženim sadje-jedim netopirjem. Epidemija se je iz Gvineje razširila v Liberijo in Sierra Leone, pri čemer je b ...
Leto:
2016
Vir:
videolectures.net
Doktorska disertacija
Oznake:
klopni meningoencefalitis;genetska raznolikost;sekvenciranje;NGS;mutacije;patogeneza;
Klopni meningoencefalitis (KME), ki ga povzroča virus klopnega meningoencefalitisa (KMEV), je najpomembnejša virusna okužba osrednjega živčevja, ki jo prenašajo klopi v Evropi. Okužba s KMEV lahko variira od asimptomatske, vročinske bolezni, do hude oblike z nevrološkimi znaki, vendar vzroki za tako ...
Leto:
2023
Vir:
Medicinska fakulteta (UL MF)
Diplomsko delo
Oznake:
amplikoni;ortohantavirus Dobrava;sekvenciranje genoma;sekvenciranje naslednje generacije;diplomska dela;
Naravni gostitelji ortohantavirusov so glodavci (Rodentia), rovke (Soricidae) in netopirji (Chiroptera). Ortohantavirusi, ki povzročajo bolezni pri ljudeh, se v naravi ohranjajo v glodavcih in rovkah. V diplomski nalogi smo se osredotočili na vrsto Orthohantavirus dobravaense (virus Dobrava; DOBV), ...
Leto:
2025
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Jan Slunečko,
Rok Kogoj,
Samo Zakotnik,
Alen Suljič,
Nataša Knap,
Martin Bosilj,
Franc Strle,
Tatjana Avšič-Županc,
Petra Bogovič,
Petra Bogovič,
Miša Korva,
Miša Korva
Izvirni znanstveni članek
Oznake:
mNGS;clinical metagenomics;molecular diagnostics;universal pathogen detection;enhanced RNA virus detection;
Introduction: Blood culture is the cornerstone of microbiological diagnostics for patients with acute undifferentiated fever and no obvious localization of infection; however, up to 50% of cases remain undiagnosed. Infections caused by arboviruses, fastidious or even uncultivable bacteria, or parasi ...
Leto:
2025
Vir:
Medicinska fakulteta (UL MF)
Lučka Boltežar,
Rok Kogoj,
Katarina Resman Rus,
Alen Suljič,
Martin Bosilj,
Nataša Knap,
Polonca Mali,
Janez Tomažič,
Tatjana Avšič-Županc,
Miša Korva,
Miša Korva
Kratki znanstveni prispevek
Oznake:
B-cell lymphoma;hematological malignancies;microbiome;prolonged SARS-CoV_2 infection;virus evolution;virus shedding;
Background: Respiratory microbiome alterations, coinfections, and virus intrahost evolution are of great interest in persistently viable SARS-CoV-2 infections in the context of antiviral treatment and immune response. However, samples before, during, and after infection are seldom available to resea ...
Leto:
2025
Vir:
Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije
Alen Suljič,
Tomaž Mark Zorec,
Samo Zakotnik,
Doroteja Vlaj,
Rok Kogoj,
Nataša Knap,
Miroslav Petrovec,
Mario Poljak,
Tatjana Avšič-Županc,
Miša Korva,
Miša Korva
Izvirni znanstveni članek
Oznake:
COVID-19;SARS-CoV-2;complete-genome sequencing;molecular surveillance;next-generation sequencing;spike gene;
The emergence and rapid spread of SARS-CoV-2 prompted the global community to identify innovative approaches to diagnose infection and sequence the viral genome because at several points in the pandemic positive case numbers exceeded the laboratory capacity to characterize sufficient samples to adeq ...
Leto:
2024
Vir:
Medicinska fakulteta (UL MF)
Doktorska disertacija
Oznake:
virusi;hantavirusi;Puumala;Dobrava;hemoragična mrzlica z renalnim sindromom;HMRS;človeški levkocitni antigeni;HLA;virusno breme;genetska raznolikost;patogeneza;
Vpliv genetske variabilnosti v HLA lokusu in hantavirusnega tipa na patogenezo hemoragične mrzlice z renalnim sindromom
Leto:
2011
Vir:
Medicinska fakulteta (UL MF)
Magistrsko delo
Oznake:
arbovirusi;virus Sindbis;komarji;genotip IV;NGS;filogenetska sorodnost;
Arbovirusi so virusi, ki v naravi krožijo med členonožnimi prenašalci, komarji, klopi in peščenimi muhami, in naravnimi gostitelji kot so ptice in mali sesalci. Ljudje se okužijo z arbovirusi ob vbodu okuženega prenašalca, kadar je gostota prenašalcev in gostiteljev v okolju zelo visoka. Med medicin ...
Leto:
2024
Vir:
Medicinska fakulteta (UL MF)
Magistrsko delo
Oznake:
virusi;flavivirusi;standardne serološke metode;kemiluminescenčni testi;klinična opredelitev;
Arbovirusne okužbe pri ljudeh lahko povzročijo širok spekter simptomov, od asimptomatskih okužb do življenjsko nevarnih stanj. Zaradi kratke viremije pri arbovirozah pogosto zamudimo diagnostično okno za neposreden dokaz virusa, vendar pa lahko okužbo potrdimo z dokazom specifičnih protiteles z razl ...
Leto:
2026
Vir:
Medicinska fakulteta (UL MF)