Iskalni niz:
išči po
išči po
išči po
išči po
Vrsta gradiva:
Jezik:
Št. zadetkov: 18
Načrtovanje, razvoj in testiranje računalniškega programa za 2D in 3D virtualno rešetanje na osnovi liganda
Samo Lešnik, Stanislav Gobec, Janez Konc
Magistrsko delo
Oznake: virtualno rešetanje;maksimalna klika;molekulski graf;dvodimenzionalni deskriptorji;tridimenzionalni deskriptorji;
Načrtovanje, razvoj in testiranje računalniškega programa za 2D in 3D virtualno rešetanje na osnovi liganda
Leto: 2013 Vir: Fakulteta za farmacijo (UL FFA)
Scaffold hopping and bioisosteric replacements based on binding site alignments
Samo Lešnik, Janez Konc, Dušanka Janežič
Izvirni znanstveni članek
Oznake: analizne metode;struktura snovi;modeliranje;
Bioisosteric replacements and scaffold hopping play an important role in modern drug discovery and design, as they enable the change of either a core scaffold or substitutes in a drug structure, thereby facilitating optimization of pharmacokinetic properties and patenting, while the drug retains its ...
Leto: 2016 Vir: Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije
Razvoj računalniške baze bioizosternih zamenjav in programa za virtualno rešetanje na osnovi liganda
Samo Lešnik, Janez Konc, Stanislav Gobec
Doktorska disertacija
Oznake: farmacija;načrtovanje zdravilnih učinkovin;računalniške metode;računalniško podprto načrtovanje;računalniški algoritmi;teorija grafov;knjižnice molekul;virtualno rešetanje;tarče;ligandi;bioizosterije;skeletni preskok;bioaktivne snovi;Alzheimerjeva bolezen;LiSiCa - Ligand Similarity using Clique Algorithm;LiSiCa algoritem;baza BoBER;doktorske disertacije;
Vedno naprednejše in hitrejše računalniške metode imajo pomembno vlogo v različnih fazah sodobnega načrtovanju zdravilnih učinkovin. Virtualno rešetanje je postalo nepogrešljiv del iskanja novih aktivnih spojin (zadetkov) v začetnih stopnjah razvoja zdravil. Virtualno rešetanje lahko delimo na virtu ...
Leto: 2017 Vir: Fakulteta za farmacijo (UL FFA)
Mechanistic insights of polyphenolic compounds from rosemary bound to their protein targets obtained by molecular dynamics simulations and free-energy calculations
Samo Lešnik, Marko Jukič, Urban Bren
Izvirni znanstveni članek
Oznake: rožmarin;linearna interakcija energije;proteaza;polifenoli;rosemary;carnosic acid;carnosol;rosmanol;rosmarinic acid;polyphenols;molecular docking;molecular dynamics simulations;linear interaction energy calculations;water-mediated hydrogen-bonds;; HIV-1 protease;K-RAS protein;factor X;
Leto: 2023 Vir: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UM FKKT)
Mehanizem stabilizacije humanega transportnega proteina transtiretina z rožmarinsko kislino
Meta Kočevar, Urban Bren, Samo Lešnik
Magistrsko delo
Oznake: transtiretin;transtiretinska amiloidoza;rožmarinska kislina;simulacije molekulske dinamike;polje sil;stabilnost proteina;
Dedna transtiretinska amiloidoza je avtosomno dominantna bolezen. Nastane kot posledica mutacije v proteinu transtiretinu. Mutacije povzročajo strukturne spremembe proteina, ki jim sledi disociacija v monomere in kasneje agregacija monomerov ter tvorba amiloidnih vlakenc. Vlakenca se nalagajo v tkiv ...
Leto: 2024 Vir: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UM FKKT)
Loop grafting between similar local environments for Fc-silent antibodies
Samo Lešnik, Milan Hodošček, Barbara Podobnik, Janez Konc
Izvirni znanstveni članek
Oznake: biokemija;biološka zdravila;zdravljenje raka;ProBis;
Loop grafting between similar local environments for Fc-silent antibodies
Leto: 2020 Vir: Kemijski inštitut (KI)
Ligand-based virtual screening interface between PyMOL and LiSiCA
Athira Dilip, Samo Lešnik, Tanja Štular, Dušanka Janežič, Janez Konc
Izvirni znanstveni članek
Oznake: LiSiCA;PyMOL;informatika;aplikacije;
Ligand-based virtual screening of large small-molecule databases is an important step in the early stages of drug development. It is based on the similarity principle and is used to reduce the chemical space of large databases to a manageable size where chosen ligands can be experimentally tested. L ...
Leto: 2016 Vir: Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije
ǂThe ǂeffect of the Ala16Val mutation on the secondary structure of the manganese superoxide dismutase mitochondrial targeting sequence
Matic Broz, Veronika Furlan, Samo Lešnik, Marko Jukič, Urban Bren
Izvirni znanstveni članek
Oznake: polimorfizmi;dinamika molekul;manganese superoxide dismutase;polymorphism rs4880;mutation Ala16Va;molecular dynamics simulations;oxidative stress;
Manganese Superoxide Dismutase (MnSOD) represents a mitochondrial protein that scavenges reactive oxygen species (ROS) responsible for oxidative stress. A known single nucleotide polymorphism (SNP) rs4880 on the SOD2 gene, causing a mutation from alanine to valine (Ala16Val) in the primary structure ...
Leto: 2022 Vir: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UM FKKT)
Small-moleculs inhibitors of 6-phosphofructo-1-kinase simultaneously suppress Lactate and Superoxide generation in cancer cells – data used in the article
Matic Legiša, Samo Lešnik, Janez Konc, Tina Vodopivec, Urška Karolina Potokar, Katja Čamernik
Ni določena
Oznake:
Leto: 0 Vir: Kemijski inštitut (KI)
Stereoselective activity of 1-propargyl-4-styrylpiperidine-like analogues that can discriminate between monoamine oxidase isoforms A and B
Damijan Knez, Natalia Colettis, Luca G. Iacovino, Matej Sova, Anja Pišlar, Janez Konc, Samo Lešnik, Josefina Higgs, Fabiola Kamecki, Irene Mangialavori, Ana Dolšak, Simon Žakelj, Jurij Trontelj, Janko Kos, Claudia Binda, Nora Marder Mariel, Stanislav Gobec
Izvirni znanstveni članek
Oznake: razvoj zdravil;toksikologija zdravil;monoamin oksidaze;
The resurgence of interest in monoamine oxidases (MAOs) has been fueled by recent correlations of this enzymatic activity with cardiovascular, neurological, and oncological disorders. This has promoted increased research into selective MAO-A and MAO-B inhibitors. Here, we shed light on how selective ...
Leto: 2020 Vir: Fakulteta za farmacijo (UL FFA)
Št. zadetkov: 18
Ključne besede:
Leto izdaje:
Avtorji:
Repozitorij:
Tipologija:
Jezik: