Metka Šiško (Avtor)

Povzetek

The main goal of the Slovene Plant Gene Bank is preservation, maintenance and evaluation of traditional cultivars and other useful genotypes. The Faculty of Agriculture and Life Sciences houses among other plant materials also numerous accessions of plums (Prunus domestica L.). Duplicates among 15 accessions were studied using six microsatellite primer pairs. These microsatellite markers revealed an average of 7.67 alleles per locus, and a range of 4 to 10 different alleles per locus. The genetic distances between studied accessions were calculated using the Dice coefficient to form a dendrogram. The six SSRs were found to be adequate for differentiating among genotypes within the collection. Among the analysed accessions no duplicates were found.

Ključne besede

genska banka;podvojene akcesije;Prunus domestica;slive;mikrosatelitski markerji;

Podatki

Jezik: Slovenski jezik
Leto izida:
Tipologija: 1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija: UM FKBV - Fakulteta za kmetijstvo in biosistemske vede
UDK: 631.52:634.22
COBISS: 4310060 Povezava se bo odprla v novem oknu
ISSN: 1580-8432
Matična publikacija: Agricultura
Št. ogledov: 930
Št. prenosov: 372
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Angleški jezik
Sekundarni naslov: Identifikacija morebitnih duplikatov med akcesijami sliv (Prunus domestica L.) znotraj Slovenske rastlinske genske banke z uporabo molekulskih markerjev
Sekundarni povzetek: Slovenska rastlinska genska banka skrbi za ohranjanje, vzdrževanje in vrednotenje tradicionalnih kultivarjev in drugih uporabnih genotipov rastlin. Fakulteta za kmetijstvo in biosistemske vede skrbi med drugim tudi za številne akcesije sliv (Prunus domestica L.). Med 15 izbranimi akcesijami, smo s pomočjo šestih mikrosatelitskih lokusov želeli poiskati morebitne duplikate. Z mikrosatelitskimi markerji smo v povprečju namnožili 7.67 alelov na lokus in dobili od 4 do 10 različnih alelov na posamezen lokus. Za računanje genetskih oddaljenosti med proučevanimi akcesijami smo izračunali Dice koeficient in izrisali dendrogram. Šest mikrosatelitskih lokusov je zadostovalo za razlikovanje med akcesijami. Med preučevanimi akcesijami nismo našli duplikatov.
Sekundarne ključne besede: gene bank;duplicate accessions;Prunus domestica;plums;SSR markers;
URN: URN:NBN:SI
Vrsta dela (COBISS): Znanstveno delo
Strani: str. 57-64
Letnik: ǂVol. ǂ13
Zvezek: ǂNo. ǂ1/2
Čas izdaje: Dec. 2016
DOI: 10.1515/agricultura-2017-0007
ID: 10878846