magistrsko delo
Ivana Podlipnik (Avtor), San Hadži (Mentor), Franc Požgan (Član komisije za zagovor), Jurij Lah (Član komisije za zagovor)

Povzetek

Za proteine obstajajo tako imenovane adicijske sheme, s pomočjo katerih je možno napovedati parcialno molsko toplotno kapaciteto denaturiranega (razvitega) stanja za poljuben protein na osnovi števila posameznih aminokislin v tem proteinu, kar je ključnega pomena za raziskave stabilnosti. V tem magistrskem delu sem se lotila raziskave aditivnosti parcialne toplotne kapacitete nukleotidov v DNK in razvoja enačbe, ki bi služila kot adicijska shema za oceno parcialne molske toplotne kapacitete denaturiranega (razvitega) stanja poljubnih enoverižnih DNK na podlagi merjenja parcialne molske toplotne kapacitete krajšim modelnim spojinam (DNK oligonukleotidov) z diferenčno dinamično kalorimetrijo. Določila sem prispevke za posamezne oligonukleotide (A, T, C, G) in tako parametrizirala enačbo za napoved parcialne molske toplotne kapacitete. Napovedane vrednosti se v grobem ujemajo s podatki, zato bi bilo potrebno parametre v enačbi izboljšati. Potencial za izboljšavo vidim v upoštevanju okolice oziroma najbližjih sosedov, ki imajo nezanemarljiv vpliv na prispevek posameznega nukleotida k parcialni molski toplotni kapaciteti.

Ključne besede

toplotna kapaciteta;adicijske sheme;diferenčna dinamična kalorimetrija;DSC;magistrska dela;

Podatki

Jezik: Slovenski jezik
Leto izida:
Tipologija: 2.09 - Magistrsko delo
Organizacija: UL FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Založnik: [I. Podlipnik]
UDK: 577.31(043.2)
COBISS: 198709251 Povezava se bo odprla v novem oknu
Št. ogledov: 74
Št. prenosov: 12
Ocena: 0 (0 glasov)
Metapodatki: JSON JSON-RDF JSON-LD TURTLE N-TRIPLES XML RDFA MICRODATA DC-XML DC-RDF RDF

Ostali podatki

Sekundarni jezik: Angleški jezik
Sekundarni naslov: Determination of parcial molar heat capacity of DNA oligonucleotides
Sekundarni povzetek: For proteins, so-called additive schemes exist, which allow predicting the partial molar heat capacity of the denatured (unfolded) state for any protein based on the number of individual amino acids in that protein, which is crucial for stability research. In this master's thesis, I undertook the investigation of the additivity of the partial heat capacity of nucleotides in DNA and the development of an equation that would serve as an additive scheme for estimating the partial molar heat capacity of denatured (unfolded) states of arbitrary single-stranded DNA based on measuring the partial molar heat capacity of shorter model compounds (DNA oligonucleotides) using differential scanning calorimetry (DSC). I determined the contributions for individual nucleotides (A, T, C, G) and as such parameterized the equation for predicting the partial molar heat capacity. The predicted values roughly match the data, indicating that the parameters in the equation need improvement. Potential for improvement lies in considering the surroundings or nearest neighbors, which have a significant influence on the contribution of individual nucleotides to the partial molar heat capacity.
Sekundarne ključne besede: DSC;DNA;heat capacity;addition scheme;Termodinamika;Univerzitetna in visokošolska dela;
Vrsta dela (COBISS): Magistrsko delo/naloga
Študijski program: 1000375
Komentar na gradivo: Univ. v Ljubljani, Fak. za kemijo in kemijsko tehnologijo, smer Kemija
Strani: 1 spletni vir (1 datoteka PDF (40 str.))
ID: 24275728