Št. zadetkov: 83
Izvirni znanstveni članek
Oznake:
Trop2;zunajcelični del;ektodomena;Trop2EX;kristalna struktura;dimer;EpCAM;extracellular part;ectodomain;crystal structure;
Trop2 is a cell-surface transmembrane glycoprotein involved in the maintenance of epithelial tissue integrity and is an important carcinoma marker. It shares similar claudin-interaction capacity with its paralogue EpCAM, and both are implicated in signaling triggered by proteolytic cleavage within t ...
Leto:
2021
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Izvirni znanstveni članek
Oznake:
EpCAM;tumorski označevalec;simulacija molekulske dinamike;struktura;mreža stikov med aminokislinskimi ostanki;tumor marker;molecular dynamics simulation;structure;residue-residue contact network;
The data provided and described here give insight into the solution dynamics of the dimer of human EpCAM ectodomain (EpEX). As the starting point, crystal structure of EpEX non-covalent dimer was used (PDB ID 4MZV). The coordinates of solvent-embedded dimer were used to generate a topology file, whi ...
Leto:
2021
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
citoskelet;proteini;aktin;alfa-aktinin-4;regulacija;kalcij;izotermna titracijska kalorimetrija;ITC;metilacija;kristalizacija;diplomska dela;
α-aktinin-4 je citoskeletni protein iz družine spektrinov. Sestavljajo ga tri domene in sicer domena za vezavo aktina ter paličasta in kalmodulinu podobna domena. Aktivno obliko α-aktinina-4 predstavlja antiparalelni homodimer, katerega osrednja vloga je prečno povezovanje aktinskih filamentov, pre ...
Leto:
2019
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
interakcijski partnerji;interakcije protein-DNA;F-DNA;Tus-link72-TurboID;GAL4(1-147)-link45-sfGFP;biotinilacija;diplomska dela;
Odkrivanje in preučevanje interakcij protein–DNA je izrednega pomena, saj usmerjajo delovanje številnih celičnih procesov. Omenjene interakcije so lahko stabilne ali prehodne oz. močne ali šibke in so odvisne od pogojev, v katerih se kompleks protein–DNA nahaja. Dve ključni omejitvi klasičnih metod ...
Leto:
2019
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
proteini;epitelijska celična adhezijska molekula;EpCAM;celična adhezija;celično signaliziranje;regulirana intramembranska proteoliza;proteaze;mestnospecifična mutageneza;diplomska dela;
Epitelijska celična adhezijska molekula (EpCAM) je homodimerni transmembranski glikoprotein, vključen v procese celičnega signaliziranja. Fiziološka prisotnost povišane količine EpCAM na površini zarodnih celic epitelijskih tkiv in manjšega števila na diferenciranih celicah priča o njegovem pomenu p ...
Leto:
2020
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
citoskelet;aktin;proteini;alfa-aktinin-1;alfa-aktinin-4;heterodimerizacija;fosforilacija;bioinformatika;diplomska dela;
α-Aktinini so proteini, ki sodelujejo pri povezovanju aktinskih filamentov v večdimenzionalne strukture. Na splošno so sestavljeni iz aktin-vezavne domene, osrednje paličaste domene in kalmodulinu podobne domene. Funkcionalno proteinsko enoto predstavlja antiparalelni homodimer. α-aktinin -1 in -4 s ...
Leto:
2020
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
glikozilacija;N-vezani glikani;glikan-vezavne sonde;interakcije ligand-protein;kompozitne mreže;glikozil transferaze A;N-acetilglukozaminiltransferaza I;diplomska dela;
Skozi vse domene življenja predstavlja glikozilacija pomemben biološki proces, ki uravnava lastnosti proteinov. Končni produkti procesa glikozilacije so še posebej pomembni za obstoj večceličnih organizmov, saj se vključujejo v procese signalizacije, imunskega odziva, celične adhezije ipd. Čeprav je ...
Leto:
2021
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Pregledni znanstveni članek
Oznake:
določanje strukture;modeliranje;homo-oligomeri;structure determination;modeling;homo-oligomers;
Protein homo-oligomerization is a very common phenomenon, and approximately half of proteins form homo-oligomeric assemblies composed of identical subunits. The vast majority of such assemblies possess internal symmetry which can be either exploited to help or poses challenges during structure deter ...
Leto:
2021
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
EpCAM;metoda bližnje ligacije;TurboID;metoda "pull-down";diplomska dela;
EpCAM je transmembranski glikoprotein, ki se v celici nahaja kot cis-dimer in igra pomembno vlogo pri celičnem signaliziranju preko regulirane intramembranske proteolize (RIP). EpCAM je podvržen dvema cepitvama – α- oz. β-cepitvi ter nato še γ-cepitvi. Dimerizacija EpCAM in njegova cepitev se med se ...
Leto:
2022
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
EpCAM;hidrofobni žep;DAUDA;palmitat;tirozinska fluorescenca;diplomska dela;
EpCAM je označevalec tumorskih in matičnih celic, ki sodeluje pri signaliziranju preko regulirane intramembranske proteolitične cepitve. V kristalni strukturi zunajceličnega dela EpCAM je bil opažen hidrofoben žep z vezanim kristalizacijskim aditivom N-decil-β-D-maltopiranozid. Struktura bi lahko pr ...
Leto:
2022
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)