Iskalni niz:
išči po
išči po
išči po
išči po
Vrsta gradiva:
Jezik:
Št. zadetkov: 3
Optimizacija rabe kodonov sintetičnih genov za izražanje v E. coli s strojnim učenjem
Martin Špendl, Gregor Gunčar
Diplomsko delo
Oznake: proteini;zvijanje proteinov;translacija DNA;čas translacije;optimizacija rabe kodonov;strojno učenje;nevronska mreža;LSTM;diplomska dela;
Diplomsko delo je usmerjeno v razvoj algoritma za načrtovanje nukleotidnega zaporedja genov za izražanje v E. coli. Dosedanja metoda za optimizacijo rabe kodonov temelji na rabi posameznih kodonov skozi celoten genom. Ta način optimizacije ne upošteva časa translacije in njegove povezave z zvijanje ...
Leto: 2020 Vir: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Spletna aplikacija za optimizacijo rabe kodonov
Uroš Hekić, Luka Šajn, Martin Špendl
Magistrsko delo
Oznake: optimizacija rabe kodonov;naključni sprehod;TASEP;Docker;RabbitMQ;računalništvo in informatika;magisteriji;
Optimizacija rabe kodonov je postopek za zamenjavo sinonimnih kodonov z namenom prilagajanja rabe kodonov gostiteljskega organizma, ki se uporablja v predpripravi sinteze proteinov npr. pri izdelavi zdravil, dodatkov v živilski industriji ali pri preučevanju lastnosti proteinov v laboratoriju. Neopt ...
Leto: 2023 Vir: Fakulteta za računalništvo in informatiko (UL FRI)
Nov način optimizacije rabe kodonov z uporabo strojnega učenja na osnovi struktur proteinov
Martin Špendl, Gregor Gunčar, Aljaž Gaber, Miha Pavšič
Magistrsko delo
Oznake: kodoni;raba kodonov;sintetični geni;čas translacije;zvijanje proteinov;strojno učenje;TASEP;magistrska dela;
Izražanje sintetičnih genov v gostiteljskem organizmu zahteva prilagojeno rabo kodonov za višje izkoristke izolacije. Kljub temu da zaporedje kodonov vpliva na zvijanje proteinov, dosedanji algoritmi za optimizacijo rabe kodonov ne upoštevajo strukture proteina. S simulacijo premikanja ribosomov ...
Leto: 2022 Vir: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Št. zadetkov: 3
Ključne besede:
Leto izdaje:
Avtorji:
Repozitorij:
Tipologija:
Jezik: