Št. zadetkov: 68
Diplomsko delo
Oznake:
nanotelesa;enodomensko protitelo;koordinacija kovinskih ionov;dimerizacija;inkluzijska telesca;diplomska dela;
Nanotelesa so variabilne domene HCAb (angl. heavy chain antibody), ki jih najdemo v družini Chamelidae. So majhna, stabilna, v obliki samostojne domene, imajo veliko afiniteto do antigena in jih je enostavno izražati v bakterijskih sistemih. Zaradi svojih dobrih lastnosti na veliko področjih prekaša ...
Leto:
2019
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
proteini;zvijanje proteinov;translacija DNA;čas translacije;optimizacija rabe kodonov;strojno učenje;nevronska mreža;LSTM;diplomska dela;
Diplomsko delo je usmerjeno v razvoj algoritma za načrtovanje nukleotidnega zaporedja genov za izražanje v E. coli.
Dosedanja metoda za optimizacijo rabe kodonov temelji na rabi posameznih kodonov skozi celoten genom. Ta način optimizacije ne upošteva časa translacije in njegove povezave z zvijanje ...
Leto:
2020
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
celična smrt;nekroptoza;nekroptotični proteini;protein MLKL;označevanje proteinov;fluorescenčni proteini;diplomska dela;
Nekroptoza je ena izmed oblik programirane nekroze, pri kateri ima ključno vlogo protein MLKL (ang. mixed lineage kinase-domain like), ki ob aktivaciji oligomerizira, se vgradi v plazmalemo in povzroči sprostitev celične vsebine. V signalni poti imajo pomembno vlogo tudi drugi nekroptotični proteini ...
Leto:
2020
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
proteini;psevdokinaza MLKL;modificirana dehalogenaza;kloniranje IVA;konfokalna fluorescenčna mikroskopija;diplomska dela;
Konfokalna fluorescenčna mikroskopija omogoča opazovanje določenega proteina v celicah z uporabo fluorescenčnih označevalcev za proteine. Najpogosteje se uporablja zeleni fluorescenčni protein, ki fluorescira v zelenem spektru. A odkriva se še več novih označevalcev in eden od teh je modificirana ha ...
Leto:
2020
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
SARS-CoV-2;proteini;silicijev dioksid;nanodelci;monodisperzni delci;funkcionalizacija;diplomska dela;
Virus SARS-CoV-2 je predstavnik koronavirusov, ki se je pojavil konec leta 2019 in povzročil pandemijo covida-19. Monodiperzni delci silicijevega dioksida v raztopinah kažejo zanimive optične lastnosti, ki so uporabne pri izdelavi biosenzorja, s katerim bi lahko zaznali prisotnost virusa. Eden izmed ...
Leto:
2021
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
domena cisteinske proteaze;zeleni fluorescenčni protein;kloniranje s sestavljanjem in vivo;rekombinantni proteini;fuzijski protein;plazmidi;diplomska dela;
Domena cisteinske proteaze (CPD) je del večfunkcijskega samoprocesirajočega toksina, ki vsebujejo ponavljajoče motive (MARTX) iz Vibrio cholerae. Pri vstopu MARTX toksina v citosol evkariontske celice se zaradi prisotnosti InsP6 aktivira CPD. Ta ima avtoproteolitično aktivnost, saj cepi toksin na sa ...
Leto:
2022
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
nekroptoza;protein MLKL;M33 nanotelo;fluorescenčni protein mCherry;kromotelo;Flp-In;diplomska dela;
Kinazi podoben protein mešanega rodu, krajše MLKL, je protein s pomembno vlogo pri nekroptozi, vrsti programirane celične smrti z morfološkimi značilnostmi nekroze. Pri nekroptozi sodeluje tako, da tvori oligomer, ki se vgradi v membrano in s tem povzroči celično smrt. Veliko je že znanega o samem p ...
Leto:
2022
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
samoizrezujoči se označevalci;cisteinska proteazna domena;CPD;MARTX;inozitol heksakisfosfat;ojačani zeleni fluorescenčni protein;diplomska dela;
Cisteinska proteazna domena (CPD) izhaja iz večfunkcijskega samoprocesirajočega toksina, ki vsebuje ponavljajoče motive (MATRX), iz bakterije Vibrio cholerae. Domena je odgovorna za virulentnost toksina, saj s cepitvijo na več mestih aktivira ostale domene, med njimi tudi domeno, ki kovalentno povez ...
Leto:
2022
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Diplomsko delo
Oznake:
Neisseria gonorrhoeae;Obg protein;IVA kloniranje;diplomska dela;
Neisseria gonorrhoeae je patogena bakterija, ki povzroča spolno prenosljivo bolezen gonorejo. Njena sposobnost izmikanja imunskemu sistemu in povzročanju večkratnih okužb povzroča težave pri zdravljenju bolezni. Trenutno zdravljenje s cefalosporini postaja vse manj učinkovito, s pojavom odpornih sev ...
Leto:
2023
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)
Izvirni znanstveni članek
Oznake:
prečno povezovanje;homo-oligomeri;nedoločljivost prečnih povezav;topilu dostopne razdalje;modeliranje;chemical cross-linking;homo-oligomers;cross-link assignation ambiguity;solvent accessible surface distances;modeling;
Background:
The function of oligomeric proteins is inherently linked to their quaternary structure. In the absence of high-resolution data, low-resolution information in the form of spatial restraints can significantly contribute to the precision and accuracy of structural models obtained using co ...
Leto:
2019
Vir:
Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (UL FKKT)